Watchmaker Genomics lance TAPS+, élargissant ses capacités multimodales en oncologie avant l’AMP 2025

- TAPS+ permet la détection simultanée de la méthylation et des variants génétiques, ouvrant ainsi de nouvelles perspectives pour l’oncologie de précision et la recherche translationnelle.
- Préserve l’intégrité de l’ADN dans des échantillons cliniquement pertinents difficiles à analyser, notamment les tissus FFPE et l’ADN tumoral circulant (ctDNA).
- La chimie indépendante de la plateforme permet une intégration transparente entre les systèmes de séquençage.

BOULDER, Colorado--(BUSINESS WIRE)--Watchmaker Genomics a annoncé aujourd’hui le lancement de TAPS+, une technologie de nouvelle génération qui combine les lectures génétiques et épigénétiques d’une même molécule d’ADN. En capturant plusieurs dimensions biologiques dans un seul test, TAPS+ offre une vision plus riche et plus complète de la biologie tumorale, avec la possibilité de faire progresser les applications en oncologie translationnelle, en détection précoce du cancer, en surveillance de la réponse au traitement, en fragmentomique et en évaluation de la maladie résiduelle minimale.

Principales caractéristiques de la chimie TAPS+

Les techniques traditionnelles d’analyse de la méthylation, telles que le traitement au bisulfite, réduisent efficacement la diversité des séquences de quatre bases à trois, tout en endommageant souvent l’ADN. TAPS+ surmonte ces limites grâce à une chimie à lecture positive qui convertit en douceur uniquement les cytosines méthylées en thymines, laissant les cytosines non méthylées inchangées. Cela préserve la complexité naturelle à quatre bases de l’ADN, permettant un profilage précis de la méthylation et une amélioration de la qualité de lecture et de la détection des variants à travers le génome.

S’appuyant sur l’expertise de Watchmaker en matière d’ingénierie enzymatique et d’optimisation des flux de travail, TAPS+ harmonise le séquençage multimodal en une préparation de bibliothèque automatisable réalisée en seulement six heures. La chimie préserve l’intégrité des échantillons, améliore la couverture CpG, permet l’appel de variants somatiques et réduit les faux positifs, fournissant des résultats cohérents et de haute qualité, même à partir d’échantillons à faible rendement, dégradés et cliniquement pertinents, tels que les tissus FFPE et l’ADN tumoral circulant (ctDNA).

Faire progresser le profilage des tumeurs

Parmi plus de 50 évaluateurs précoces, Matija Snuderl, directeur de la pathologie moléculaire à NYU Langone Health, a utilisé TAPS+ pour explorer le profilage génomique et épigénomique combiné dans l’analyse des tumeurs.

« Avec TAPS+, nous pouvons détecter directement le 5mC parallèlement aux facteurs génétiques, même à partir d’échantillons difficiles comme le FFPE ou l’ADNct provenant du liquide céphalo-rachidien », déclare Matija Snuderl. « La combinaison d’un flux de travail unifié et d’une chimie améliorée offre le type d’informations multimodales que nous attendions en oncologie de précision. »

Matija Snuderl présentera les résultats démontrant l’utilisation de TAPS+ pour le profilage intégré de la méthylation et du génome des tumeurs lors de la réunion annuelle 2025 de l’Association for Molecular Pathology (AMP). Sa présentation, intitulée Integrated Genomic–Epigenetic Profiling of CNS Tumors with TAPS+ for Direct 5mC Detection from ctDNA and FFPE, aura lieu le mercredi 12 novembre à 12h00 ET dans la salle 153C.

Large compatibilité et accessibilité

Conçu pour être compatible avec toutes les plateformes, TAPS+ s’intègre de manière transparente à tous les systèmes de séquençage. Lors de la réunion annuelle 2025 de l’ASHG, Roche a présenté les résultats de faisabilité générés sur son instrument non commercialisé. Ultima Genomics a mis en avant des données démontrant les performances de TAPS+ sur l’UG 100™, soulignant la flexibilité et la compatibilité de la chimie sur toutes les plateformes. Contrairement à d’autres technologies de méthylation limitées par des licences restrictives, Watchmaker s’engage à permettre une large utilisation de TAPS+ par ses clients dans des applications de recherche et de diagnostic sur plusieurs plateformes de séquençage. Cette approche ouverte et collaborative permet aux chercheurs et aux laboratoires cliniques d’intégrer TAPS+ dans leurs écosystèmes existants, accélérant ainsi la transition vers l’analyse génomique et épigénomique multimodale dans la recherche translationnelle, la biologie du développement, le vieillissement, la neurobiologie et l’oncologie.

Pour en savoir plus sur TAPS+ : https://www.watchmakergenomics.com/taps.html

Notes aux éditeurs :

Publication historique sur TAPS :

Liu, Y., Siejka-Zielińska, P., Velikova, G. et al. Bisulfite-free direct detection of 5-methylcytosine and 5-hydroxymethylcytosine at base resolution. Nat Biotechnol 37, 424–429 (2019). https://doi.org/10.1038/s41587-019-0041-2

Publications sur l’utilité de TAPS pour la biopsie liquide :

Vavoulis, D.V., Cutts, A., Thota, N. et al. Multimodal cell-free DNA whole-genome TAPS is sensitive and reveals specific cancer signals. Nat Commun 16, 430 (2025). https://doi.org/10.1038/s41467-024-55428-y

Siejka-Zielińska P, Cheng J, Jackson F, et al. Cell-free DNA TAPS provides multimodal information for early cancer detection. Sci Adv. 2021;7(36):eabh0534. doi:10.1126/sciadv.abh0534

À propos de Watchmaker Genomics

Watchmaker Genomics est une société spécialisée dans les sciences de la vie qui se consacre au développement d’outils hautement performants destinés à la recherche génomique et aux applications cliniques. S’appuyant sur son expertise en ingénierie des protéines et en séquençage de nouvelle génération, Watchmaker fournit des réactifs et des plateformes de précision qui offrent une exactitude, une efficacité et une rentabilité supérieures dans le domaine de l’analyse moléculaire. La société se consacre à la mise au point de technologies de pointe afin de soutenir les innovations dans les domaines de la détection du cancer, de l’épigénétique et des applications de biopsie liquide.

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